Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM193AP78312 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM193AP78312 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms