Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms