Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH15P55291 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH15P55291 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms