Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms