Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA4P51532 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms