Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERFP50548 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERFP50548 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms