Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NESP48681 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NESP48681 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NESP48681 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NESP48681 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NESP48681 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NESP48681 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms