Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRXP46100 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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