Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSFMP43897 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TSFMP43897 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSFMP43897 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms