Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms