Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF9P41273 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms