Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms