Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHI3L1P36222 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms