Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms