Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms