Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD1P28340 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD1P28340 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD1P28340 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms