Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 532.7 ms