Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms