Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKACGP22612 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms