Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD247P20963 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms