Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms