Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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