Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA2P17301 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms