Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms