Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms