Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOLR1P15328 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOLR1P15328 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOLR1P15328 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOLR1P15328 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOLR1P15328 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOLR1P15328 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOLR1P15328 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms