Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms