Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH1P12830 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms