Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms