Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms