Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDN1P05305 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDN1P05305 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EDN1P05305 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EDN1P05305 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms