Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APODP05090 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APODP05090 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APODP05090 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APODP05090 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APODP05090 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APODP05090 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APODP05090 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
APODP05090 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APODP05090 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APODP05090 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APODP05090 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APODP05090 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APODP05090 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms