Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMG1P04279 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms