Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL18O94889 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms