Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMUO75648 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMUO75648 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRMUO75648 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms