Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF208O43345 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF208O43345 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms