Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNMO15061 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms