Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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