Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms