Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms