Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms