Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms