Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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