Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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