Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL13PA6NNM8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms