Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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HDGFL3Q9Y3E1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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