Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP11Q9Y3A2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms