Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms