Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms