Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms